Magorium um senhor de 243 anos de idade, mas com o espírito, criatividade e disposição de criança, é o dono da loja de brinquedos mais fantástica do mundo (Empório de Maravilhas). Lá se encontram todos os tipos de brinquedos, e mais que isso, os brinquedos são mágicos. Porém, Sr. Magorium decide contratar um contador, Henry Weston, para cuidar de toda a questão burocrática da loja, já que precisa deixá-la com alguém quando ele morrer. Molly, uma mulher encantadora que sonha em ser uma grande pianista, é a gerente da loja. Quando a loja percebe a instabilidade da transição de Magorium para Molly, coisas estranhas começam a acontecer. E com a ajuda do pequeno Eric, um garoto que não tem amigos e cada dia está com um chapéu diferente na cabeça, Molly, Magorium e Henry tentam trazer de novo a magia da loja.
